TaqMan Probe hay Probe được dịch là “đoạn dò” là những đoạn DNA sợi đơn có trình tự bắt cặp bổ sung với một trình tự đặc hiệu trên DNA đích. Probe thường có chiều dài dao động từ 24-30 bases với đầu 5’ gắn chất phát huỳnh quang (gọi là Reporter) và 3’ gắn chất hấp phụ tương ứng (còn gọi là Quencher). Một số chất phát huỳnh quang ở đầu 5’ có thể kể đến là FAM, HEX, ROX, Cy5… Và chất hấp phụ huỳnh quang tương ứng ở đầu 3’ có thể kể đến là TAMRA, BHQ1, BHQ2…
Probe được sử dụng làm chất phát huỳnh quang trong các phản ứng Real-time PCR (PCR định lượng hay quantitative PCR). Giúp theo dõi quá trình khuếch đại sản phẩm qua mỗi chu kỳ.
Probe được tinh sạch bằng phương pháp HPLC và kiểm tra lại bằng phương pháp MS trước khi xuất hàng.
PHUSA Biochem cung cấp dịch vụ tổng hợp các dạng Probe:
|
Fluorescence dye |
Quencher |
Fluorescence dye |
Quencher |
|
FAM |
BHQ1/BHQ2/TAMRA |
Cyanine 3 |
BHQ2 |
|
HEX |
Cyanine 5 |
||
|
TET |
TAMRA |
||
|
ROX |
BHQ2/BHQ3 |
QUASAR 705 |
BHQ3 |
|
TEXAS RED |
JOE |
BHQ2/BHQ3 |
|
|
CAL FLUOR 610 |
CAL FLUOR ORANGE |
BHQ1/BHQ2 |
|
|
QUASAR 670 |
CAL FLUOR GOLD 540 |
BHQ2/BHQ3 |
|
|
QUASAR 570 |
FAM-HEX |
T-BHQ1 |
| Name | Oligo Length (base) | Guarantee OD Delivered | Estimated Purity | Turnaround Time | Pricing (VND) |
|---|---|---|---|---|---|
| Probe.Premium 01 | 6 - 35 | 5 | 90% | 15-20 days | 4.300/base |
| Probe.premium 02 | 36 - 50 | 5 | 90% | 15-20 days | 5.000/base |
| Tên | Code 5' | Code 3' | Scale | Flourescent Range | Quenching Range | Fees |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 5'FAM-3'TAMRA | /5'-FAM/ | /3'-TAMRA/ | 200 nmol | 495-520 | 470-560 | 4.000.000 |
| 5'HEX-3'TAMRA | /5'-HEX/ | /3'-TAMRA/ | 200 nmol | 535-556 | 470-560 | 4.000.000 |
| 5'TET-3'TAMRA | /5'-TET/ | /3'-TAMRA/ | 200 nmol | 521-536 | 470-560 | 4.000.000 |
| 5'JOE-3'TAMRA | /5'-JOE/ | /3'-TAMRA/ | 200 nmol | 522-548 | 470-560 | 4.200.000 |
| 5'FAM-3'BHQ1 | /5'-FAM/ | /3'-BHQ1/ | 200 nmol | 495-520 | 480-580 | 2.800.000 |
| 5'HEX-3'BHQ1 | /5'-HEX/ | /3'-BHQ1/ | 200 nmol | 535-556 | 480-580 | 4.000.000 |
| 5'TET-3'BHQ1 | /5'-TET/ | /3'-BHQ1/ | 200 nmol | 521-536 | 480-580 | 4.200.000 |
| 5'JOE-3'BHQ1 | /5'-JOE/ | /3'-BHQ1/ | 522-548 | 480-580 | 4.200.000 | |
| 5'YakimaYellow-3'BHQ1 | /5'-YakimaYellow/ | /3'-BHQ1/ | 200 nmol | 530-549 | 480-580 | 4.200.000 |
| 5'Cal Fluor Orange 560-3'BHQ1 | 5'-Cal.Fluor560/ | /3'-BHQ1/ | 200 nmol | 538-559 | 480-580 | 4.200.000 |
| 5'Cal Fluor Gold 540-3'BHQ1 | /5'-Cal.Fluor540/ | /3'-BHQ1/ | 200 nmol | 522-544 | 480-580 | 6.185.000 |
| 5'TET-3'BHQ2 | /5'-TET/ | /3'-BHQ2/ | 200 nmol | 521-536 | 550-650 | 4.200.000 |
| 5'Cy3-3'BHQ2 | /5'-Cy3/ | /3'-BHQ2/ | 200 nmol | 549-566 | 550-650 | 4.200.000 |
| 5'Cy5-3'BHQ2 | /5'-Cy5/ | /3'-BHQ2/ | 200 nmol | 646-669 | 550-650 | 6.185.000 |
| 5'TAMRA-3'BHQ2 | /5'-TAMRA/ | /3'-BHQ2/ | 200 nmol | 557-583 | 550-650 | 4.200.000 |
| 5'ROX-3'BHQ2 | /5'-ROX/ | /3'-BHQ2/ | 200 nmol | 586-610 | 550-650 | 6.185.000 |
| 5'Texas Red-3'BHQ2 | /5'-Texas Red/ | /3'-BHQ2/ | 200 nmol | 597-616 | 550-650 | 6.185.000 |
| 5'Cal Fluor Red 610-3'BHQ2 | /5'-CalFlo.Red610/ | /3'-BHQ2/ | 200 nmol | 590-610 | 550-650 | 6.185.000 |
| 5'Quasar 670-3'BHQ2 | /5'-Quasar 670/ | /3'-BHQ2/ | 200 nmol | 647-670 | 550-650 | 6.185.000 |
| 5'Quasar 570-3'BHQ2 | /5'-Quasar 570/ | /3'-BHQ2/ | 200 nmol | 548-566 | 550-650 | 6.185.000 |
| 5'Quasar 705-3'BHQ2 | /5'-Quasar 705/ | /3'-BHQ2/ | 200 nmol | 690-705 | 550-650 | 6.185.000 |
| 5'Cal Flour Orange 560-3'BHQ2 | /5'-CalFloOra 560/ | /3'-BHQ2/ | 200 nmol | 538-559 | 550-650 | 6.185.000 |
| 5'Cy5-3'BHQ3 | /5'-Cy5/ | /3'-BHQ3/ | 200 nmol | 646-669 | 620-730 | 6.185.000 |
| 5'Quasar 670-3'BHQ3 | /5'-Quasar 670/ | /3'-BHQ3/ | 200 nmol | 647-670 | 620-730 | 6.185.000 |
| 5'Quasar 705-3'BHQ3 | /5'-Quasar 705/ | /3'-BHQ3/ | 200 nmol | 690-705 | 620-730 | 6.185.000 |
